Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1450563	1450639	77	61 [0]	[0] 14	atoC	fused response regulator of ato opeon, in two‑component system with AtoS

GCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTT  >  minE/1450509‑1450562                                                      | gCTTTCCAACGTTATTGAACGGGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:419521/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGCTCAtttt  <  1:3393246/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:3631054/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:3060708/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:3109549/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:3121314/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:3143732/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:3147813/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:3200085/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:324426/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:3295628/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:333385/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:3351316/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:3374465/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:3379755/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:3507588/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:1108069/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:402400/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:417585/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:42052/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:523666/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:758516/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:758551/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:808299/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:828867/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:842940/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:91451/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:932598/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:94016/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:951178/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:2946688/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:1038237/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:1115254/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:1176311/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:1257513/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:1314353/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:1384116/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:1539365/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:1540747/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:1572336/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:1588810/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:161159/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:1672047/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:1755677/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:1906371/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:2986215/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:2867069/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:2559370/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:2520492/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:2382774/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:2343716/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:2267600/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:2180175/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:2179384/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:2169915/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:193324/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:1862641/54‑1 (MQ=255) gCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGGCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:1171937/54‑1 (MQ=255)  cTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:1594648/53‑1 (MQ=255)     tCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCATGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:9898/50‑1 (MQ=255)             tATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCAtttt  <  1:16537/42‑1 (MQ=255)                                                      | GCTTTCCAACGTTATTGAACGCGCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTT  >  minE/1450509‑1450562

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑