Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1498192	1498245	54	67 [0]	[0] 9	nuoC	NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain C,D

TTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCG  >  minE/1498130‑1498191                                                              | tttGCTGGAATTGCGCAAAGCTCGGGGTTCGAACACGGGTGCGGTATCTCATGGTGCTGCCg  <  1:2588892/62‑1 (MQ=38) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTTCGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:354939/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:3030936/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:3401616/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:3378222/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:3339939/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:3294586/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:3255401/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:3167157/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:3043256/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:3497881/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:29714/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:2964618/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:2846048/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:2805117/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:2709683/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:1029283/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:2704073/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:366026/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:45546/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:515086/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:532496/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:592625/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:665482/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:6736/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:687229/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:706705/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:71616/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:744012/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:80152/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:831344/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:927604/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:1798745/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:1047627/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:1060450/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:1186749/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:1197864/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:1212320/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:121427/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:1237685/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:1629149/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:1639994/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:1674953/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:1691494/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:1743335/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:1788941/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:1793807/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:2658398/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:2209510/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:2597918/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:2561080/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:2377/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:2373389/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:2246738/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:214480/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:2134790/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:2092523/62‑1 (MQ=255) tttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGACg  <  1:3542772/62‑1 (MQ=255)  ttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:1710559/61‑1 (MQ=255)  ttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:304289/61‑1 (MQ=255)  ttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:210107/61‑1 (MQ=255)  ttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:2804136/61‑1 (MQ=255)  ttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:2785819/61‑1 (MQ=255)  ttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:2086456/61‑1 (MQ=255)  ttGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGAGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:1239875/61‑1 (MQ=255)                    gCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:1801242/43‑1 (MQ=255)                      tCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCg  <  1:2400240/41‑1 (MQ=255)                                                              | TTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCG  >  minE/1498130‑1498191

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑