Missing coverage evidence...
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CTGCCGTCGTACTCAATGCCCAGCGCAATTTTATAAACTGGCGGTTGTTGCTGGTCG  >  minE/1520827‑1520883                                                         | ctGCCGTCGTACTCAATGCCCAGCTCAATTTTATAAACTGGCGGTTGTTGCTGGTCg  >  1:1451413/1‑57 (MQ=255) ctGCCGTCGTACTCAATGCCCAGCGCAATTTTATAAACTGGCGGTTGTTGCTGGTCg  >  1:2710562/1‑57 (MQ=255) ctGCCGTCGTACTCAATGCCCAGCGCAATTTTATAAACTGGCGGTTGTTGCTGGTCg  >  1:859946/1‑57 (MQ=255) ctGCCGTCGTACTCAATGCCCAGCGCAATTTTATAAACTGGCGGTTGTTGCTGGTCg  >  1:805294/1‑57 (MQ=255) ctGCCGTCGTACTCAATGCCCAGCGCAATTTTATAAACTGGCGGTTGTTGCTGGTCg  >  1:609564/1‑57 (MQ=255) ctGCCGTCGTACTCAATGCCCAGCGCAATTTTATAAACTGGCGGTTGTTGCTGGTCg  >  1:353171/1‑57 (MQ=255) ctGCCGTCGTACTCAATGCCCAGCGCAATTTTATAAACTGGCGGTTGTTGCTGGTCg  >  1:3347231/1‑57 (MQ=255) ctGCCGTCGTACTCAATGCCCAGCGCAATTTTATAAACTGGCGGTTGTTGCTGGTCg  >  1:3312059/1‑57 (MQ=255) ctGCCGTCGTACTCAATGCCCAGCGCAATTTTATAAACTGGCGGTTGTTGCTGGTCg  >  1:3307986/1‑57 (MQ=255) ctGCCGTCGTACTCAATGCCCAGCGCAATTTTATAAACTGGCGGTTGTTGCTGGTCg  >  1:3076904/1‑57 (MQ=255) ctGCCGTCGTACTCAATGCCCAGCGCAATTTTATAAACTGGCGGTTGTTGCTGGTCg  >  1:2933023/1‑57 (MQ=255) ctGCCGTCGTACTCAATGCCCAGCGCAATTTTATAAACTGGCGGTTGTTGCTGGTCg  >  1:292650/1‑57 (MQ=255) ctGCCGTCGTACTCAATGCCCAGCGCAATTTTATAAACTGGCGGTTGTTGCTGGTCg  >  1:2794930/1‑57 (MQ=255) ctGCCGTCGTACTCAATGCCCAGCGCAATTTTATAAACTGGCGGTTGTTGCTGGTCg  >  1:1281831/1‑57 (MQ=255) ctGCCGTCGTACTCAATGCCCAGCGCAATTTTATAAACTGGCGGTTGTTGCTGGTCg  >  1:2619822/1‑57 (MQ=255) ctGCCGTCGTACTCAATGCCCAGCGCAATTTTATAAACTGGCGGTTGTTGCTGGTCg  >  1:2545889/1‑57 (MQ=255) ctGCCGTCGTACTCAATGCCCAGCGCAATTTTATAAACTGGCGGTTGTTGCTGGTCg  >  1:2033973/1‑57 (MQ=255) ctGCCGTCGTACTCAATGCCCAGCGCAATTTTATAAACTGGCGGTTGTTGCTGGTCg  >  1:1991409/1‑57 (MQ=255) ctGCCGTCGTACTCAATGCCCAGCGCAATTTTATAAACTGGCGGTTGTTGCTGGTCg  >  1:1909195/1‑57 (MQ=255) ctGCCGTCGTACTCAATGCCCAGCGCAATTTTATAAACTGGCGGTTGTTGCTGGTCg  >  1:1571963/1‑57 (MQ=255) ctGCCGTCGTACTCAATGCCCAGCGCAATTTTATAAACTGGCGGTTGTTGCTGGTCg  >  1:1448173/1‑57 (MQ=255) ctGCCGTCGTACTCAATGCCCAGCGCAATTTTATAAACTGGCGGTTGTTGCTGGTCg  >  1:1441814/1‑57 (MQ=255) ctGCCGTCGTACTCAATGCCCAGCGCAATTTTATAAACTGGCGGTTGTTGCTGGTCg  >  1:131232/1‑57 (MQ=255)                                                         | CTGCCGTCGTACTCAATGCCCAGCGCAATTTTATAAACTGGCGGTTGTTGCTGGTCG  >  minE/1520827‑1520883

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑