Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1539135	1539139	5	44 [0]	[0] 84	yfcU	predicted export usher protein

TCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCCATCAT  >  minE/1539073‑1539134                                                              | tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:375177/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:3186405/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:1146079/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:3234820/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:323484/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:3301106/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:3345291/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:3345532/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:3443921/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:3576140/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:3586441/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:319844/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:422766/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:466057/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:467577/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:468307/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:521593/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:541952/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:878510/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:92372/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:993249/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:2105254/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:1151643/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:1165255/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:117530/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:1181168/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:1379997/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:1524004/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:1660953/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:1698430/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:2076508/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:3076637/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:212616/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:2239237/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:2392787/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:2590325/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:2616421/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:2994292/62‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:3039289/62‑1 (MQ=255)  cAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:3251892/61‑1 (MQ=255)          gagaAAAATCCCCCTTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:1229828/53‑1 (MQ=255)                  tCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:2494907/45‑1 (MQ=255)                      cccTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:3372959/41‑1 (MQ=255)                          cGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCcatcat  <  1:3601767/37‑1 (MQ=255)                                                              | TCAGCACCAGAGAAAAATCCCCCCTCGACATGGTGGCCCCACTCTTGCGGACGTCCCATCAT  >  minE/1539073‑1539134

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑