Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1562221	1562223	3	83 [0]	[0] 31	evgS	hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with EvgA

TAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTA  >  minE/1562161‑1562220                                                            | tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:2963679/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:3357113/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:3290324/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:3256751/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:3253814/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:3235306/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:316763/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:3122595/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:3106105/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:31055/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:3075319/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:3407220/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:2919040/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:2874002/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:2867660/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:2823800/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:2643076/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:2453168/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:2411185/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:2360510/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:2305322/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:521007/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:94449/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:923587/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:880390/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:758246/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:755724/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:738961/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:698941/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:682371/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:669779/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:664658/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:2304473/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:520199/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:487438/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:464029/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:434326/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:422812/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:403608/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:384423/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:352578/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:3492882/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:1466301/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:1661661/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:1635998/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:1630125/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:1615054/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:1612830/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:1581320/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:157302/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:1551678/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:1521614/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:1517950/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:1722434/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:132991/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:1323222/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:1322059/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:1263011/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:1256447/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:1148075/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:111160/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:1044200/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:1023005/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:1731245/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:2269174/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:2264827/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:2213780/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:2125908/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:2107546/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:2092213/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:2081493/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:2073923/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:1966282/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:1918930/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:188106/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:1870354/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:1856011/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:181166/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:179397/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:1783502/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:176965/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:1008188/1‑60 (MQ=255) tAAGAACACCAATAAGCTCTAATATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTa  >  1:1921403/1‑60 (MQ=255)                                                            | TAAGAACACCAATAAGCTCTATTATGGGCTTCCTGGAACTTCTGTCGGGTTCTGGTCTTA  >  minE/1562161‑1562220

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑