Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1572364	1572445	82	78 [0]	[0] 62	gltX	glutamyl‑tRNA synthetase

TTTACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATA  >  minE/1572303‑1572363                                                             | tttACACGCT‑ATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCTGCGCTTTGTTGATa  <  1:3298623/60‑1 (MQ=255)   tACACGCTATTTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCTATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:2537273/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTTCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:2046046/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCTAGCGCTTTGTTGATa  <  1:3264745/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:3492841/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:3498182/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:3449927/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:3409215/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:3162434/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:3115203/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:3090816/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:301025/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:2992707/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:2925261/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:2870087/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:2852370/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:2742156/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:2708174/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:2680559/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:2666974/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:452076/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:992053/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:856679/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:837963/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:814419/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:802785/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:762/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:590922/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:514753/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:506092/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:2419424/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:446224/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:445310/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:434099/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:402428/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:3635379/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:3552518/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:3521716/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:3517559/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:1333448/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:1782307/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:1677515/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:1666563/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:1640804/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:1538337/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:1512386/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:1433121/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:1373463/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:2345792/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:1314675/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:1273387/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:1251189/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:1242940/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:1237717/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:1193324/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:1184707/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:1090806/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:2020884/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:1088145/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:2330180/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:2301433/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:2290643/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:203933/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:2029130/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:1810002/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:2016310/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:2005027/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:1971680/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:1920662/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:1879849/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:1852497/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:184559/59‑1 (MQ=255)   tACACGCTAATAACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:1327547/59‑1 (MQ=255)    acacGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:561767/58‑1 (MQ=255)    acacGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:2040464/58‑1 (MQ=255)    acacGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:2300140/58‑1 (MQ=255)       cGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:1824850/55‑1 (MQ=255)                      aTTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATa  <  1:1798815/40‑1 (MQ=255)                                                             | TTTACACGCTAATTACTGCTGATTTTCGCGTTCAGCAATAAAATCCAGCGCTTTGTTGATA  >  minE/1572303‑1572363

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑