Missing coverage evidence...
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GGTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGC  >  minE/1593708‑1593768                                                             | ggTTTGCTGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:1090030/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:3473838/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:2624495/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:268281/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:275983/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:2827988/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:28706/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:2936406/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:296766/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:308453/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:3234963/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:3292186/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:2492169/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:3632247/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:416141/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:540879/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:692382/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:717983/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:781872/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:869078/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:908651/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:912960/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:1765900/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:1089709/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:1283194/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:1287429/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:134285/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:1365214/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:1368181/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:1505627/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:1731021/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:1752710/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:1072355/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:1831812/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:1831819/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:1857365/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:1876699/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:2065947/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:2260236/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:2274088/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:2288651/1‑61 (MQ=255) ggTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGc  >  1:2390827/1‑61 (MQ=255)                                                             | GGTTTGATGCTCCAGCCCGGCGATAATGCGCAGCAGCGTGGTTTTCCCGGAACCGGACGGC  >  minE/1593708‑1593768

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑