Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1600219	1600226	8	45 [0]	[0] 29	murP	fused predicted enzyme IIBC components of PTS

ACGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGAA  >  minE/1600157‑1600218                                                              | aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:3438264/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:2571466/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:2611549/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:2644141/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:264503/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:2718568/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:276900/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:2802772/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:3039991/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:3127465/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:3271374/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:1050365/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:344943/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:3540753/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:385887/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:396185/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:544746/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:583284/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:586889/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:626060/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:727525/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:2495757/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:1020494/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:1090936/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:1111977/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:1280696/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:1422887/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:1482131/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:1531334/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:1603862/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:1619032/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:1633721/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:1698272/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:1748954/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:1872283/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:2054137/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:207192/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:2311452/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:2384382/62‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:2554830/62‑1 (MQ=255)  cGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:3311707/61‑1 (MQ=255)  cGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:1890487/61‑1 (MQ=255)  cGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:2484791/61‑1 (MQ=255)  cGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:861509/61‑1 (MQ=255)                     aGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGaa  <  1:668477/42‑1 (MQ=255)                                                              | ACGGTGATGCACGTTCCGGCAGATGCTCAGGGAACACTACCCGATGCGCTGAATTTTATGAA  >  minE/1600157‑1600218

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑