Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	138782	138863	82	65 [0]	[0] 66	htrE	predicted outer membrane usher protein

ATCAATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGCC  >  minE/138721‑138781                                                             | atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:2907287/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:3355515/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:3335518/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:3283836/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:3150999/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:3117753/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:3105464/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:3016261/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:2921880/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:3391137/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:2876817/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:2866934/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:2806429/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:2788461/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:2766362/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:2752099/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:2734153/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:2646816/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:3476110/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:3511300/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:438006/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:460692/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:495789/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:514422/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:61001/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:703154/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:727017/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:760184/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:774988/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:804701/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:877173/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:906423/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:986393/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:1727214/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:1094945/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:1214471/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:1231816/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:1258523/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:1342270/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:1383191/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:1389843/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:140076/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:1433226/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:1449006/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:1526960/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:1541521/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:1556714/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:1588489/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:1709016/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:1066885/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:1864199/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:1898550/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:194051/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:1968765/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:211012/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:2154157/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:2154334/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:2208640/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:2255646/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:2302830/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:2363247/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:2465386/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:2588814/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:2590641/1‑61 (MQ=255) atcaATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGcc  >  1:2628773/1‑61 (MQ=255)                                                             | ATCAATTAGAGTTAGTGCATCATTAAGACCAAGGTAATTCTGTGTCGAATAGCGATAGGCC  >  minE/138721‑138781

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑