Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1606171	1606230	60	27 [0]	[0] 13	amiA	N‑acetylmuramoyl‑l‑alanine amidase I

CCGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCT  >  minE/1606109‑1606170                                                              | ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:2374626/1‑62 (MQ=255) ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:813852/1‑62 (MQ=255) ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:711582/1‑62 (MQ=255) ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:63305/1‑62 (MQ=255) ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:3613368/1‑62 (MQ=255) ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:3524797/1‑62 (MQ=255) ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:3478488/1‑62 (MQ=255) ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:3466394/1‑62 (MQ=255) ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:3248633/1‑62 (MQ=255) ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:3240396/1‑62 (MQ=255) ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:3186401/1‑62 (MQ=255) ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:2869233/1‑62 (MQ=255) ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:240469/1‑62 (MQ=255) ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:2384891/1‑62 (MQ=255) ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:1134798/1‑62 (MQ=255) ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:2324889/1‑62 (MQ=255) ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:2324345/1‑62 (MQ=255) ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:2027865/1‑62 (MQ=255) ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:1984654/1‑62 (MQ=255) ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:1720278/1‑62 (MQ=255) ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:1652432/1‑62 (MQ=255) ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:1643685/1‑62 (MQ=255) ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:163140/1‑62 (MQ=255) ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:1429986/1‑62 (MQ=255) ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:1384866/1‑62 (MQ=255) ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:1358540/1‑62 (MQ=255) ccGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCt  >  1:1253719/1‑62 (MQ=255)                                                              | CCGTCGGTTCCTTCGGTGCTGGTGGAAACCTCGTTTATCACCAACCCGGAAGAAGAACGGCT  >  minE/1606109‑1606170

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑