Missing coverage evidence...
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AGGCACGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATCA  >  minE/1626410‑1626451                                          | aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGTTTGGTTTTTACGATca  <  1:1537280/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:3500742/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:3197485/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:3275121/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:3293100/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:331234/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:3327260/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:3414845/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:3455358/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:3496426/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:3026281/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:3602930/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:5051/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:539927/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:675557/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:901871/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:91947/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:956469/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:19238/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:1510361/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:1563006/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:1622380/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:1723634/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:1858686/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:1881030/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:1907201/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:2182191/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:2380692/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:2528594/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:264480/42‑1 (MQ=255) aggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:276057/42‑1 (MQ=255)  ggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:1104062/41‑1 (MQ=255)  ggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:37554/41‑1 (MQ=255)  ggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:2519522/41‑1 (MQ=255)  ggcaCGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATca  <  1:2640013/41‑1 (MQ=255)                                          | AGGCACGCTGGGACTGGGCAAGCTGATTGGTTTTTACGATCA  >  minE/1626410‑1626451

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑