Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1635211 1635239 29 53 [0] [0] 57 acrD aminoglycoside/multidrug efflux system

AGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCTTT  >  minE/1635149‑1635210
                                                             |
tgCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:1301775/61‑1 (MQ=255)
aGCCACAGGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:3628855/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:3193421/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:2324311/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:2488561/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:2506707/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:2593717/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:2682854/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:2777078/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:2826370/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:28529/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:2865527/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:300577/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:3020551/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:3107549/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:1051732/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:3238409/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:3449/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:3488447/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:3638065/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:374585/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:44755/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:594023/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:721147/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:7777/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:941668/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:2237/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:1036346/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:1071105/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:1091842/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:1174721/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:1194237/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:1245230/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:131559/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:1325076/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:151923/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:1639691/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:1760998/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:1780021/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:1809335/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:1824623/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:1841293/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:1874210/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:1887145/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:1945924/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:2236986/62‑1 (MQ=255)
aGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:2283385/62‑1 (MQ=255)
 gCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:2077567/61‑1 (MQ=255)
 gCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:1073128/61‑1 (MQ=255)
  ccACACGTAAATCTATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:2736194/60‑1 (MQ=255)
       cGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:2162615/55‑1 (MQ=255)
          aaaTCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:1812161/52‑1 (MQ=255)
           aaTCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCttt  <  1:960176/51‑1 (MQ=255)
                                                             |
AGCCACACGTAAATCGATGGGGCAGATCCAGGGGGCACTGGTCGGGATTGCGATGGTTCTTT  >  minE/1635149‑1635210

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: