Missing coverage evidence...
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TTGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGC  >  minE/1648792‑1648853                                                              | ttGAAAAAAAACCTGGTTGCACCCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:197549/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:3362463/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:2481094/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:2503275/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:2564323/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:2570488/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:2684423/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:2711467/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:2721097/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:2739594/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:3015888/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:3304923/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:2403390/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:3404395/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:3442622/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:3452999/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:3453588/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:3456858/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:3490186/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:669388/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:770941/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:802829/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:854584/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:993763/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:1751423/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:1115438/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:1145543/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:131488/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:1337749/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:1374257/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:1440560/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:1476780/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:1644614/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:1649870/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:1668213/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:1672280/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:1031986/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:1889015/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:1907962/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:1913192/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:1954381/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:1999004/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:2028593/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:2097647/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:2127216/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:2134573/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:2258816/1‑62 (MQ=255) ttGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATAGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGc  >  1:3158760/1‑62 (MQ=255)                                                              | TTGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGC  >  minE/1648792‑1648853

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑