Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1674210	1674271	62	64 [0]	[0] 8	ispG	1‑hydroxy‑2‑methyl‑2‑(E)‑butenyl 4‑diphosphate synthase

TTACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAGC  >  minE/1674150‑1674209                                                            | ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGTCAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:1470057/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTTAgc  <  1:2533539/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:3356670/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:1070387/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:2674758/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:274759/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:2811083/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:2825982/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:2931903/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:2988609/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:3044165/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:3044893/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:3188930/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:3265244/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:32802/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:3325540/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:2523649/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:3404048/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:3592372/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:373552/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:408495/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:438191/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:540932/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:56244/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:639318/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:646102/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:668547/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:686263/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:890598/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:973370/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:1988548/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:1182905/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:123956/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:137082/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:1425098/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:1426933/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:1463207/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:1507149/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:1521664/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:1586932/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:1618073/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:1658123/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:1778625/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:1840927/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:2355580/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:2007319/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:2010809/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:2043255/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:2065778/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:2103623/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:2104439/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:2143536/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:2284454/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:2340619/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:2339051/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:2289641/60‑1 (MQ=255) ttACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:2330756/60‑1 (MQ=255)  tACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:2042417/59‑1 (MQ=255)  tACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:616502/59‑1 (MQ=255)      gATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:2285400/55‑1 (MQ=255)       atatTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:2563354/54‑1 (MQ=255)         atTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:235739/52‑1 (MQ=255)                   ttAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:938881/42‑1 (MQ=255)                    tAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAgc  <  1:92324/41‑1 (MQ=255)                                                            | TTACCGATATTGCCAGGGTTAATACGCAGACAATCGACGCCGTATTCCGCTACTTTCAGC  >  minE/1674150‑1674209

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑