Missing coverage evidence...
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ACCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAT  >  minE/1683351‑1683412                                                              | aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:47925/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:2937149/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:1099471/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:3115141/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:3300061/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:3566095/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:3625933/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:387845/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:389947/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:397162/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:402616/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:465989/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:2939276/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:507732/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:585657/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:645439/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:698417/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:766293/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:78528/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:844499/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:909529/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:927083/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:994662/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:2012120/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:1115258/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:1160605/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:1266127/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:1388374/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:1514201/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:1531675/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:1558694/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:1706052/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:181814/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:189349/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:1935340/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:1950139/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:2933204/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:2508034/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:2604841/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:2624308/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:2676284/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:2709484/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:27238/62‑1 (MQ=255) aCCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:2753272/62‑1 (MQ=255)  ccAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:3372381/61‑1 (MQ=255)           gCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:2837380/52‑1 (MQ=255)             tGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGATAAGTTGCCCTTGCATAGTAt  <  1:3315237/50‑1 (MQ=255)             tGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAt  <  1:317153/50‑1 (MQ=255)                                                              | ACCAGGTAAGGCTGACACAGCTTCACGCAGTGGGCGCAGGAAAAGTTGCCCTTGCAAAGTAT  >  minE/1683351‑1683412

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑