Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1701114 1701171 58 29 [0] [0] 39 hcaR DNA‑binding transcriptional regulator

TCATGTGCTAAAGGGTGATCAACCGGTAACACAACCACTAATGGTTCGTCAAAAAGCTCCA  >  minE/1701053‑1701113
                                                            |
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tCATGTGCTAAAGGGTGATCAACCGGTAACACAACCACTAATGGTTCGTCAAAAAGCTCCa  >  1:329103/1‑61 (MQ=255)
tCATGTGCTAAAGGGTGATCAACCGGTAACACAACCACTAATGGTTCGTCAAAAAGCTCCa  >  1:3135937/1‑61 (MQ=255)
tCATGTGCTAAAGGGTGATCAACCGGTAACACAACCACTAATGGTTCGTCAAAAAGCTCCa  >  1:3092810/1‑61 (MQ=255)
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tCATGTGCTAAAGGGTGATCAACCGGTAACACAACCACTAATGGTTCGTCAAAAAGCTCCa  >  1:2002065/1‑61 (MQ=255)
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tCATGTGCTAAAGGGTGATCAACCGGTAACACAACCACTAATGGTTCGTCAAAAAGCTCCa  >  1:173125/1‑61 (MQ=255)
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tCATGTGCTAAAGGGTGATCAACCGGTAACACAACCACTAATGGTTCGTCAAAAAGCTCCa  >  1:1406767/1‑61 (MQ=255)
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tCATGTGCTAAAGGGTGATCAACCGGTAACACAACCACTAATGGTTCGTCAAAAAGCTCCa  >  1:117295/1‑61 (MQ=255)
tCATGTGCTAAAGGGTGATCAACCGGTAACACAACCACTAATGGTTCGTCAAAAAGCTCCa  >  1:1075092/1‑61 (MQ=255)
                                                            |
TCATGTGCTAAAGGGTGATCAACCGGTAACACAACCACTAATGGTTCGTCAAAAAGCTCCA  >  minE/1701053‑1701113

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: