Missing coverage evidence...
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TCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAC  >  minE/1720312‑1720372                                                             | tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:438323/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:1142437/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:3357305/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:3364316/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:3383533/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:3455919/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:3530238/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:3577232/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:384039/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:396171/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:419019/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:3202224/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:457283/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:461817/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:577675/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:594012/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:608077/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:725687/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:741170/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:74979/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:850013/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:96579/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:2070169/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:1278361/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:1303181/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:1477548/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:1487314/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:1578082/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:1710746/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:1811442/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:1813971/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:2019980/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:3144703/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:2170987/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:2231660/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:2471861/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:2671298/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:276081/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:2790545/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:283043/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:2881707/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:2993854/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:3035675/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCCCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:579436/61‑1 (MQ=255) tCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTATCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAc  <  1:763011/61‑1 (MQ=255)                                                             | TCAACAAAGGTTGGCAGCGCCGTATTTTCACCCTCCAGCGCCTGCTCCACCAGCGCATCAC  >  minE/1720312‑1720372

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑