Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1771298	1771415	118	10 [0]	[0] 47	pheA	fused chorismate mutase P and prephenate dehydratase

CACCCGATTTGTGGTGTTGGCGCGTAAAGCCATTAAC  >  minE/1771261‑1771297                                     | cACCCGATTTGTGGTGTTGGCGCGTAAAGCCATTAAc  <  1:109957/37‑1 (MQ=255) cACCCGATTTGTGGTGTTGGCGCGTAAAGCCATTAAc  <  1:141846/37‑1 (MQ=255) cACCCGATTTGTGGTGTTGGCGCGTAAAGCCATTAAc  <  1:1606455/37‑1 (MQ=255) cACCCGATTTGTGGTGTTGGCGCGTAAAGCCATTAAc  <  1:1727355/37‑1 (MQ=255) cACCCGATTTGTGGTGTTGGCGCGTAAAGCCATTAAc  <  1:1976277/37‑1 (MQ=255) cACCCGATTTGTGGTGTTGGCGCGTAAAGCCATTAAc  <  1:2975383/37‑1 (MQ=255) cACCCGATTTGTGGTGTTGGCGCGTAAAGCCATTAAc  <  1:3173338/37‑1 (MQ=255) cACCCGATTTGTGGTGTTGGCGCGTAAAGCCATTAAc  <  1:537871/37‑1 (MQ=255) cACCCGATTTGTGGTGTTGGCGCGTAAAGCCATTAAc  <  1:838061/37‑1 (MQ=255) cACCCGATTTGTGGTGTTGGCGCGTAAAGCCATTAAc  <  1:866261/37‑1 (MQ=255)                                     | CACCCGATTTGTGGTGTTGGCGCGTAAAGCCATTAAC  >  minE/1771261‑1771297

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑