Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1785722 1785733 12 65 [0] [0] 6 recN recombination and repair protein

CGATCGATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTT  >  minE/1785661‑1785721
                                                            |
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:3583135/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:2610285/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:2880778/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:2895541/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:2907707/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:3032567/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:3054761/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:3290979/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:3295191/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:3295684/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:3393093/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:3410767/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:3446614/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:3518234/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:3520864/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:3538870/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:2491326/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:3626146/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:561393/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:583859/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:595178/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:611513/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:680803/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:696122/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:706337/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:70999/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:752021/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:75306/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:865739/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:936073/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:949444/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:997251/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:1480200/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:1848168/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:1816283/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:1726431/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:1680071/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:1634930/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:1578042/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:1544315/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:1520044/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:1864884/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:1468449/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:1415632/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:1364195/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:1356487/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:1346486/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:1168274/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:1091081/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:1032989/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:1890333/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:1924835/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:193891/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:1972530/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:1974436/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:2207562/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:2214393/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:2217451/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:2225807/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:2255821/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:2282360/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:237708/61‑1 (MQ=255)
cgatcgatGTTAAATTTGACGAGCATCACCTAGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:2309323/61‑1 (MQ=255)
            aaTTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:1999229/49‑1 (MQ=255)
               ttGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACTGTGCCGATCGTATTGAGtt  <  1:2766306/46‑1 (MQ=255)
                                                            |
CGATCGATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTT  >  minE/1785661‑1785721

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: