Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1798681	1798700	20	91 [0]	[0] 11	proV	glycine betaine transporter subunit

CACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCG  >  minE/1798646‑1798680                                   | cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:3190425/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:3500104/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:3458761/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:3447721/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:3437912/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:3433855/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:3431751/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:3409728/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:3343646/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:3283274/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:3280020/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:3223461/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:3505071/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:3102024/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:298961/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:2930402/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:2894861/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:2887981/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:284607/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:2804642/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:2791396/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:275029/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:2740405/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:650286/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:978689/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:894562/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:891436/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:827154/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:820642/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:78850/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:781174/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:758520/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:753851/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:710028/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:675414/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:2729905/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:596109/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:457323/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:442582/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:414312/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:398932/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:395210/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:3607973/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:3575984/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:3574776/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:3539008/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:1543797/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:1940416/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:1930257/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:1909324/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:1773778/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:1758024/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:1681078/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:1667887/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:1631209/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:162269/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:1591900/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:2699628/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:1381205/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:1243221/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:1227477/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:1208544/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:1203486/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:1103201/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:1070697/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:1057997/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:1047410/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:2395675/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:1004309/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:2687271/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:2637360/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:2621055/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:2611480/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:2487237/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:2479930/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:246413/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:1995882/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:2291758/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:2243356/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:2206918/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:2181752/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:2170836/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:2096109/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:2051042/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:203345/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:2029771/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATAGGCGACCg  >  1:1398452/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATAGGCGACCg  >  1:2548435/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAAGCCATGAGTATTGGCGACCg  >  1:1882438/1‑35 (MQ=255) cACGATCTTGATGAACCCATGCGTATTGCCGACCg  >  1:1389401/1‑35 (MQ=38) cACGATATTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCg  >  1:1940367/1‑35 (MQ=255)                                   | CACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCG  >  minE/1798646‑1798680

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑