Missing coverage evidence...
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GCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACT  >  minE/1805756‑1805815                                                            | gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:2528682/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:979382/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:851527/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:830599/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:817456/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:70273/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:423696/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:3481481/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:3251730/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:3144190/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:3084682/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:2933566/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:2889630/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:2668888/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:2628402/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:2573451/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:1001613/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:2385194/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:2228940/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:2211664/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:2167857/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:1964311/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:1672891/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:164029/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:1599202/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:1545632/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:1436604/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:1205949/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:1140380/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:1106647/60‑1 (MQ=255) gCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:1069314/60‑1 (MQ=255)                        tgATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACt  <  1:1003525/37‑1 (MQ=255)                                                            | GCTGGCTAATCCAGAGGTGCGTGTGATGCAACAGCAAAAACCGCTGGAAGGCGCGCAACT  >  minE/1805756‑1805815

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑