Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	160113	160121	9	44 [0]	[0] 36	degP	serine endoprotease (protease Do), membrane‑associated

CATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGC  >  minE/160122‑160183 |                                                              cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:3293612/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:1051901/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:2430562/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:2670906/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:2797827/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:299342/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:3053489/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:3189564/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:321487/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:2366445/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:3392284/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:373129/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:396138/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:518859/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:788924/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:85139/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:956694/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:1822213/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:1142005/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:1174064/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:1197419/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:1204051/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:1280197/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:1316505/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:1557735/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:1693842/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:2260755/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:1973455/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:2098506/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:2173721/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:2182310/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:2212459/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:2218710/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:2247479/62‑1 (MQ=255) cATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATAcgc  <  1:2503118/62‑1 (MQ=255) cATTAAACTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc  <  1:472328/62‑1 (MQ=255) |                                                              CATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGC  >  minE/160122‑160183

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑