Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1836653	1836655	3	8 [0]	[0] 41	rpoS	RNA polymerase, sigma S (sigma 38) factor

ATGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTT  >  minE/1836656‑1836700 |                                             aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:3372629/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:258850/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:2708811/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:2939179/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:2948829/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:301447/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:3203740/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:3339901/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:3343906/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:3370889/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:2446420/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:3622989/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:376703/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:433139/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:437386/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:517309/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:543387/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:574824/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:906496/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:953692/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:1797755/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:1258590/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:1265795/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:1303684/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:1396981/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:1497826/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:1555196/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:1567516/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:1701958/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:1750505/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:1130332/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:1926377/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:1936455/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:2143045/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:2173956/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:2189618/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:2250448/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:226740/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:2402032/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:240881/1‑45 (MQ=255) aTGGGACAACTCACGTGCGGTTCGAAGGTAAACGTTCAGCTCCtt  >  1:3510986/1‑45 (MQ=255) |                                             ATGGGACAACTCACGTGCGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTT  >  minE/1836656‑1836700

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑