Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1840362	1840441	80	6 [0]	[0] 36	truD	pseudoruidine synthase

CTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTA  >  minE/1840442‑1840503 |                                                              cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTGCCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:2072494/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:3119918/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:2813547/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:2817843/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:2837905/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:2873357/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:2877930/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:2923294/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:295641/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:3009978/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:2804309/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:3255494/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:3346759/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:3401459/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:3594906/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:385114/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:545856/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:624097/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:763353/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:1729380/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:1078018/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:109133/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:116523/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:1244810/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:1250089/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:1278121/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:1506334/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:1672841/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:1042389/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:1878863/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:2210081/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:2242131/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:2271767/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:2417706/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:2418157/62‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTa  <  1:2623802/62‑1 (MQ=255) |                                                              CTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGAAGTAGTTCGGTA  >  minE/1840442‑1840503

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑