Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1840826	1840868	43	28 [0]	[0] 41	truD	pseudoruidine synthase

CCCAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCGG  >  minE/1840869‑1840930 |                                                              cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:3483851/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:2899247/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:2999577/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:3005263/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:3166880/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:3172059/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:3209748/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:3221864/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:3323978/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:3421564/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:2815281/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:353385/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:3609706/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:417460/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:448956/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:492745/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:592805/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:594573/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:701510/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:952503/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:1858787/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:1238677/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:1276921/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:1298973/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:1319896/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:1361701/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:1535779/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:1566863/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:1726667/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:1833778/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:1039977/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:1980215/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:2353906/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:2374840/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:2478935/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:2506071/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:2517589/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:2768420/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:2769521/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:2789830/62‑1 (MQ=255) cccAAATCTACCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCgg  <  1:662939/62‑1 (MQ=255) |                                                              CCCAAATCTTCCACCACCACAAAGTCTTCCGGATTGGCTTTCAGCAGCCCGGTGCCTTGCGG  >  minE/1840869‑1840930

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑