Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	161485	161492	8	74 [0]	[0] 32	cdaR	DNA‑binding transcriptional regulator

GTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTC  >  minE/161493‑161554 |                                                              gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGt   >  1:2958104/1‑61 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGt   >  1:1010450/1‑61 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGt   >  1:2538388/1‑61 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGt   >  1:364803/1‑61 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGt   >  1:1726645/1‑61 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGt   >  1:2276216/1‑61 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGt   >  1:3388620/1‑61 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTc  >  1:3463013/1‑62 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTc  >  1:3131478/1‑62 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTc  >  1:3158943/1‑62 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTc  >  1:3322986/1‑62 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTc  >  1:2870563/1‑62 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTc  >  1:3527945/1‑62 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTc  >  1:3581652/1‑62 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTc  >  1:407150/1‑62 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTc  >  1:54592/1‑62 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTc  >  1:558572/1‑62 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTc  >  1:635606/1‑62 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTc  >  1:3086405/1‑62 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTc  >  1:2835372/1‑62 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTc  >  1:2308728/1‑62 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTc  >  1:2302857/1‑62 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTc  >  1:2100057/1‑62 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTc  >  1:1967441/1‑62 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTc  >  1:1865677/1‑62 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTc  >  1:1803246/1‑62 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTc  >  1:1546437/1‑62 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTc  >  1:1417831/1‑62 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTc  >  1:131835/1‑62 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTc  >  1:1310254/1‑62 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTc  >  1:1012610/1‑62 (MQ=255) gTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACAGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTc  >  1:3184385/1‑62 (MQ=255) |                                                              GTCATCTGCACGGTGTGCGGCAGGGGATTAATCTACCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTC  >  minE/161493‑161554

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑