Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1841286	1841307	22	61 [0]	[0] 56	ispF	2C‑methyl‑D‑erythritol 2,4‑cyclodiphosphate synthase

ATCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATGC  >  minE/1841308‑1841347 |                                        aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGa      >  1:321730/1‑36 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:3410950/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:272223/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:2768306/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:2953298/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:3041278/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:3062979/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:3072450/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:3073136/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:3074173/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:3194460/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:325737/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:3366275/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:3396523/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:2675231/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:3412001/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:3434199/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:3519853/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:3527978/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:3594949/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:372519/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:418663/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:431745/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:595633/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:748910/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:818489/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:984109/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:987891/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:1982792/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:1113615/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:122299/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:1250529/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:1301643/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:1330398/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:1386412/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:1447850/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:1707196/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:1805869/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:1837085/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:1865377/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:197122/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:1097297/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:1985657/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:2034479/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:2186918/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:2197682/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:2202022/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:2236147/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:2413551/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:2469775/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:2515623/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:2527410/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:2578034/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:2604654/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:2639899/1‑40 (MQ=255) aTCGGTCAACGAATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATgc  >  1:148536/1‑40 (MQ=255) |                                        ATCGGTCAACGCATGGAGCGCCACGTCGCCATCAGAATGC  >  minE/1841308‑1841347

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑