Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	162501	162509	9	6 [0]	[0] 62	cdaR/yaeH	DNA‑binding transcriptional regulator/conserved hypothetical protein

CCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCT  >  minE/162510‑162571 |                                                              cccGAATTAACCGTCAGTTCGTGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:2692759/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:3396579/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:2907626/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:2928251/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:292851/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:2937409/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:297258/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:2973279/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:3038741/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:3111261/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:3199664/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:3217183/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:3263432/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:3264811/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:3300319/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:3314939/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:1223395/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:3417130/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:3462547/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:364198/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:37640/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:412224/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:42369/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:424831/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:510977/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:519420/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:531543/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:554128/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:674723/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:73455/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:774869/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:983512/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:2165936/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:1183879/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:1309410/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:1349020/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:1474018/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:1580789/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:1638133/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:1744174/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:1759670/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:1779512/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:1949761/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:1952654/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:2010029/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:2072140/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:2163853/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:2177573/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:2208910/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:2225426/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:224039/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:2327498/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:2363323/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:2442762/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:2444772/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:2476341/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:2503996/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:264744/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:2686661/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:2707260/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAAtct  <  1:2720277/62‑1 (MQ=255) cccGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGATTCAAtct  <  1:285215/62‑1 (MQ=255) |                                                              CCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCT  >  minE/162510‑162571

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑