Missing coverage evidence...
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CATGCGCAATGGACATTGCACCATCAACTTTTCCCAACTCAGTCATCATGCCGCTGGTTGCC  >  minE/1851066‑1851127 |                                                              cATGCGCAATGGACATTGCACCGTCAACTTTTCCCAACTCAGTCATCATGCCGCTGGTTGcc  >  1:1417165/1‑62 (MQ=255) cATGCGCAATGGACATTGCACCATCAACTTTTccc                             >  1:3592850/1‑35 (MQ=255) cATGCGCAATGGACATTGCACCATCAACTTTTCGCAACTCAGTCATCATGc             >  1:1579855/1‑51 (MQ=255) cATGCGCAATGGACATTGCACCATCAACTTTTCCCATCTCAGTCATCATGCCGCTGGTTGcc  >  1:1229292/1‑62 (MQ=255) cATGCGCAATGGACATTGCACCATCAACTTTTCCCAACTCAGTcatcat               >  1:3038677/1‑49 (MQ=255) cATGCGCAATGGACATTGCACCATCAACTTTTCCCAACTCAGTCATCATGcc            >  1:781731/1‑52 (MQ=255) cATGCGCAATGGACATTGCACCATCAACTTTTCCCAACTCAGTCATCATGCCGCTGGTTGcc  >  1:3437146/1‑62 (MQ=255) cATGCGCAATGGACATTGCACCATCAACTTTTCCCAACTCAGTCATCATGCCGCTGGTTGcc  >  1:3421589/1‑62 (MQ=255) cATGCGCAATGGACATTGCACCATCAACTTTTCCCAACTCAGTCATCATGCCGCTGGTTGcc  >  1:3409724/1‑62 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑