Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1861236	1861377	142	11 [0]	[0] 69	cysJ	sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein

CATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGCC  >  minE/1861378‑1861430 |                                                     cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTTTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:2095054/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:3211091/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:3384661/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:3369764/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:3354643/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:3296634/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:3284062/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:3252313/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:3232826/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:3396967/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:3202391/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:3140364/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:3018715/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:288171/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:28269/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:2820541/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:2817080/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:2735074/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:3607523/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:962838/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:785482/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:763731/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:606177/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:563410/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:558248/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:545599/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:3615326/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:2728100/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:3589855/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:3580500/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:3568383/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:3498935/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:34776/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:3454138/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:3450405/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:1567846/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:1848334/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:1801168/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:1746584/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:1722272/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:1702453/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:1669372/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:1624477/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:1614930/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:1923186/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:1559065/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:1518600/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:1476907/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:1401576/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:1304263/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:1217573/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:1043768/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:2371568/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:2683208/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:2588518/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:2565699/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:2537309/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:249149/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:247740/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:2391648/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:1007735/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:230544/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:2282010/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:2276085/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:2254374/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:2225066/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:2059550/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:2058451/53‑1 (MQ=255) cATGCGTCGTTAAGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGcc  <  1:2819923/53‑1 (MQ=255) |                                                     CATGCGTCGTTATGTTCCAGTAAGCAAAGCTGTTTCTGCGCCCTGTCAGCGCC  >  minE/1861378‑1861430

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑