Missing coverage evidence...
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GTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTGGG  >  minE/1864087‑1864148 |                                                              gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:412637/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:1067585/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:3119122/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:3282273/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:3347602/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:3371861/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:3402391/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:3419431/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:3533844/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:3535850/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:3553854/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:361607/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:384339/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:2806290/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:506685/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:564707/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:606057/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:70779/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:767020/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:784662/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:786546/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:847424/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:853572/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:891897/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:954611/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:1978914/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:1276101/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:1373608/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:1384555/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:141977/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:1463656/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:1516051/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:155769/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:1721133/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:1938205/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:1942391/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:2762544/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:2024762/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:2056363/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:2057078/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:2138337/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:2195632/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:24975/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:2636936/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:2649330/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:2690355/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:2710501/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:2758104/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCCGATTGCCGGTggg  <  1:2373887/62‑1 (MQ=255) gTATGCCCAAAGTCCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:582313/62‑1 (MQ=255) gTAAGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTggg  <  1:531396/62‑1 (MQ=255) |                                                              GTATGCCCAAAGTGCTGGGCTGGGTGACAGAGAAAATCCGCCAACCGCTGATTGCCGGTGGG  >  minE/1864087‑1864148

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑