Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1885514	1885550	37	17 [0]	[0] 70	barA	hybrid sensory histidine kinase, in two‑component regulatory system with UvrY

CAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAG  >  minE/1885551‑1885612 |                                                              cAAATAATTTGCTTGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:3229057/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTTGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:2590562/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGTCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:1204523/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAGACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:2846056/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCATGTAAg  <  1:1192711/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:2780461/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:3188246/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:3094173/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:3082730/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:2953326/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:2910261/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:2900173/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:279556/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:3231801/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:2470998/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:2443695/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:2436051/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:2407249/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:2403118/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:3214725/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:2289315/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:3360815/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:3470503/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:3481076/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:3539227/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:3566158/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:407784/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:458792/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:476722/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:541167/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:570173/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:683645/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:753355/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:937092/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:942090/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:1362624/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:1724362/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:1695706/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:1661878/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:164694/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:1633927/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:1591546/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:1510875/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:1433675/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:174559/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:1273330/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:1170211/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:1064381/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:1050446/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:1026095/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:1024061/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:1016615/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:1786916/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:226556/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:2237547/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:2159083/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:2138778/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:2101380/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:2100369/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:2064367/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:2019062/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:1916034/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:1839855/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:183886/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:182188/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:1816546/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:179071/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:1002058/62‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACT‑GAAGCAGGTAAg  <  1:2799525/61‑1 (MQ=255) cAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACCTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAg  <  1:3596225/62‑1 (MQ=255) |                                                              CAAATAATTTGCTGGCAATTATTAATGATGTTCTCGACTTCTCGAAACTGGAAGCAGGTAAG  >  minE/1885551‑1885612

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑