Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1893584	1893595	12	103 [0]	[0] 78	mltA	membrane‑bound lytic murein transglycosylase A

GCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGA  >  minE/1893596‑1893637 |                                          gCATGCCCGTGTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGc     >  1:3133478/1‑39 (MQ=38) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTaa       >  1:3258426/1‑37 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTaa       >  1:669445/1‑37 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCgg   >  1:2828287/1‑41 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCgg   >  1:2225961/1‑41 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCgg   >  1:3238743/1‑41 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCTGa  >  1:575171/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:3469402/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:3533683/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:343903/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:3380389/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:3366020/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:3271115/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:325350/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:323311/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:322408/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:3183219/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:3101943/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:3099086/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:2898947/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:2871915/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:6219/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:921887/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:897699/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:878730/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:870742/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:778654/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:712548/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:705938/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:687741/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:3530326/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:608743/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:566557/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:51163/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:501909/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:364899/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:3567111/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:3540474/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:2797676/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:1494746/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:1737046/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:1653472/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:1649720/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:1628746/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:162300/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:1601836/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:1599480/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:1563929/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:1506648/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:1763796/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:1493131/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:1471050/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:1435955/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:1369039/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:1352830/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:1310788/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:1280257/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:1269303/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:1184918/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:2476696/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:2734666/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:2727369/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:2720607/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:2713851/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:2699859/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:2699228/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:2631544/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:249645/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:1039573/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:2417069/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:2291893/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:2114946/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:1896675/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:1887105/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:1866836/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:1826498/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:1766658/1‑42 (MQ=255) gCATGACCGTTTTTCCCAGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGa  >  1:3111155/1‑42 (MQ=255) |                                          GCATGACCGTTTTTCCCTGCATAGCTGAAAAAGTTAAGCGGA  >  minE/1893596‑1893637

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑