Missing coverage evidence...
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TTGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCACGC  >  minE/1905100‑1905161 |                                                              ttGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCAcgc  >  1:2442579/1‑62 (MQ=255) ttGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCAcgc  >  1:583795/1‑62 (MQ=255) ttGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCAcgc  >  1:573251/1‑62 (MQ=255) ttGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCAcgc  >  1:3458460/1‑62 (MQ=255) ttGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCAcgc  >  1:3249246/1‑62 (MQ=255) ttGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCAcgc  >  1:3147923/1‑62 (MQ=255) ttGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCAcgc  >  1:3123174/1‑62 (MQ=255) ttGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCAcgc  >  1:3006710/1‑62 (MQ=255) ttGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCAcgc  >  1:2963137/1‑62 (MQ=255) ttGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCAcgc  >  1:2773200/1‑62 (MQ=255) ttGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCAcgc  >  1:2688420/1‑62 (MQ=255) ttGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCAcgc  >  1:2588648/1‑62 (MQ=255) ttGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCAcgc  >  1:2472961/1‑62 (MQ=255) ttGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCAcgc  >  1:1201788/1‑62 (MQ=255) ttGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCAcgc  >  1:2255282/1‑62 (MQ=255) ttGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCAcgc  >  1:2111321/1‑62 (MQ=255) ttGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCAcgc  >  1:210046/1‑62 (MQ=255) ttGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCAcgc  >  1:2060873/1‑62 (MQ=255) ttGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCAcgc  >  1:2014851/1‑62 (MQ=255) ttGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCAcgc  >  1:197781/1‑62 (MQ=255) ttGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCAcgc  >  1:1826880/1‑62 (MQ=255) ttGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCAcgc  >  1:1753127/1‑62 (MQ=255) ttGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCAcgc  >  1:1676595/1‑62 (MQ=255) ttGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCAcgc  >  1:1633748/1‑62 (MQ=255) ttGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCAcgc  >  1:1534544/1‑62 (MQ=255) |                                                              TTGCGCGTCGGTGACTACCGGCACGGTGATTTCCGGTTTTTTGCTCTCTTTGTTCGGCACGC  >  minE/1905100‑1905161

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑