Missing coverage evidence...
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GCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAACC  >  minE/1910211‑1910271 |                                                             gCTTTAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:743254/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTa                       >  1:2741673/1‑40 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:3601181/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:3127763/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:3128945/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:3146693/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:3233187/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:3239893/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:3290234/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:3386/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:3414687/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:3417591/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:3423945/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:3518706/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:30575/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:3603347/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:3647240/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:386345/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:420174/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:526393/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:634458/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:634949/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:684821/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:802776/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:817021/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:869318/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:2200157/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:1217329/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:1293819/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:14072/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:1485502/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:1502036/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:1850113/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:1859728/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:2024069/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:21427/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:2144031/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:2192817/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:1143516/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:2227390/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:2428426/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:2449521/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:2452466/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:2505043/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:2581323/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:2601779/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:2765750/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:2850860/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:2940455/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:3023490/1‑61 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAc   >  1:3058594/1‑60 (MQ=255) gCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTACAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAAcc  >  1:1242047/1‑61 (MQ=255) |                                                             GCTATAGCTGGCATTCACCACGGTTTGCGGTTCAGACTTACTGGCAGCACGCATATTAACC  >  minE/1910211‑1910271

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑