Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1916434	1916443	10	10 [0]	[0] 41	nudH/mutH	nucleotide hydrolase/methyl‑directed mismatch repair protein

ACGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCT  >  minE/1916444‑1916498 |                                                       aCGTCATGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:722935/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAATCAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:1987167/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCTAGCt  <  1:1908964/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:3425818/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:3149541/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:3488688/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:3497725/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:3535657/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:3566151/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:3605972/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:3612436/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:3643509/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:425851/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:549093/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:661104/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:705956/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:865112/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:919528/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:919820/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:949419/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:957979/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:980637/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:2031848/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:1157143/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:1346897/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:1445881/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:1533984/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:1605105/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:1651954/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:1715461/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:1922236/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:1987137/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:3207945/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:2638545/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:2711191/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:2848673/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:288793/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:2890142/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:2908895/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:3137077/55‑1 (MQ=255) aCGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCt  <  1:1146702/55‑1 (MQ=255) |                                                       ACGTCAAGGCTGTAAATGGAAACAGTAGTGGAGGTTTTTCACAGTTATCCCAGCT  >  minE/1916444‑1916498

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑