Missing coverage evidence...
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CTTCAGGGAAAATCACCACTGGTCGGCCCTGTTCCACCAGAC  >  minE/1922736‑1922777 |                                          cTTCAGGGAAAATCACCACTGGTCGGCCCTGTTCCACCAGAc  <  1:3290346/42‑1 (MQ=255) cTTCAGGGAAAATCACCACTGGTCGGCCCTGTTCCACCAGAc  <  1:3635394/42‑1 (MQ=255) cTTCAGGGAAAATCACCACTGGTCGGCCCTGTTCCACCAGAc  <  1:3631679/42‑1 (MQ=255) cTTCAGGGAAAATCACCACTGGTCGGCCCTGTTCCACCAGAc  <  1:3537247/42‑1 (MQ=255) cTTCAGGGAAAATCACCACTGGTCGGCCCTGTTCCACCAGAc  <  1:3462683/42‑1 (MQ=255) cTTCAGGGAAAATCACCACTGGTCGGCCCTGTTCCACCAGAc  <  1:3459052/42‑1 (MQ=255) cTTCAGGGAAAATCACCACTGGTCGGCCCTGTTCCACCAGAc  <  1:3440607/42‑1 (MQ=255) cTTCAGGGAAAATCACCACTGGTCGGCCCTGTTCCACCAGAc  <  1:3409208/42‑1 (MQ=255) cTTCAGGGAAAATCACCACTGGTCGGCCCTGTTCCACCAGAc  <  1:3380256/42‑1 (MQ=255) cTTCAGGGAAAATCACCACTGGTCGGCCCTGTTCCACCAGAc  <  1:3367817/42‑1 (MQ=255) cTTCAGGGAAAATCACCACTGGTCGGCCCTGTTCCACCAGAc  <  1:3304142/42‑1 (MQ=255) cTTCAGGGAAAATCACCACTGGTCGGCCCTGTTCCACCAGAc  <  1:416832/42‑1 (MQ=255) 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CTTCAGGGAAAATCACCACTGGTCGGCCCTGTTCCACCAGAC  >  minE/1922736‑1922777

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑