Missing coverage evidence...
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GAGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGATC  >  minE/1939585‑1939646 |                                                              gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:2506439/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:970162/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:958819/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:867038/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:83989/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:448734/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:443345/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:3466346/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:3396051/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:3321791/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:3189833/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:3118888/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:283533/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:2818660/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:2655922/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:2278223/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:2263105/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:2255479/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:2181754/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:1979069/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:1946092/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:1844299/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:1735927/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:1637004/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:1265776/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:1253431/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:111636/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:1051623/62‑1 (MQ=255) gaGCGTATTCAGAGCTGGTGCAAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGAtc  <  1:1035947/62‑1 (MQ=255) |                                                              GAGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGATC  >  minE/1939585‑1939646

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑