Missing coverage evidence...
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TTCTTAAAACGATGCTACAGCAACAGGGTAGCCGCACCGAAGTCTTAAGTGGGCAACAAGCC  >  minE/172536‑172597 |                                                              ttcttAAAACGATGCTACAGCAACAGGGTAGCCGCACCGAAGTCTTAAGTGGGCAACAAGcc  >  1:2392950/1‑62 (MQ=255) ttcttAAAACGATGCTACAGCAACAGGGTAGCCGCACCGAAGTCTTAAGTGGGCAACAAGcc  >  1:533061/1‑62 (MQ=255) ttcttAAAACGATGCTACAGCAACAGGGTAGCCGCACCGAAGTCTTAAGTGGGCAACAAGcc  >  1:397594/1‑62 (MQ=255) ttcttAAAACGATGCTACAGCAACAGGGTAGCCGCACCGAAGTCTTAAGTGGGCAACAAGcc  >  1:386019/1‑62 (MQ=255) ttcttAAAACGATGCTACAGCAACAGGGTAGCCGCACCGAAGTCTTAAGTGGGCAACAAGcc  >  1:3621936/1‑62 (MQ=255) ttcttAAAACGATGCTACAGCAACAGGGTAGCCGCACCGAAGTCTTAAGTGGGCAACAAGcc  >  1:3313649/1‑62 (MQ=255) ttcttAAAACGATGCTACAGCAACAGGGTAGCCGCACCGAAGTCTTAAGTGGGCAACAAGcc  >  1:3145448/1‑62 (MQ=255) ttcttAAAACGATGCTACAGCAACAGGGTAGCCGCACCGAAGTCTTAAGTGGGCAACAAGcc  >  1:2855259/1‑62 (MQ=255) ttcttAAAACGATGCTACAGCAACAGGGTAGCCGCACCGAAGTCTTAAGTGGGCAACAAGcc  >  1:2828958/1‑62 (MQ=255) ttcttAAAACGATGCTACAGCAACAGGGTAGCCGCACCGAAGTCTTAAGTGGGCAACAAGcc  >  1:2744027/1‑62 (MQ=255) ttcttAAAACGATGCTACAGCAACAGGGTAGCCGCACCGAAGTCTTAAGTGGGCAACAAGcc  >  1:2462569/1‑62 (MQ=255) ttcttAAAACGATGCTACAGCAACAGGGTAGCCGCACCGAAGTCTTAAGTGGGCAACAAGcc  >  1:1212892/1‑62 (MQ=255) ttcttAAAACGATGCTACAGCAACAGGGTAGCCGCACCGAAGTCTTAAGTGGGCAACAAGcc  >  1:2176193/1‑62 (MQ=255) ttcttAAAACGATGCTACAGCAACAGGGTAGCCGCACCGAAGTCTTAAGTGGGCAACAAGcc  >  1:2175249/1‑62 (MQ=255) ttcttAAAACGATGCTACAGCAACAGGGTAGCCGCACCGAAGTCTTAAGTGGGCAACAAGcc  >  1:2104007/1‑62 (MQ=255) ttcttAAAACGATGCTACAGCAACAGGGTAGCCGCACCGAAGTCTTAAGTGGGCAACAAGcc  >  1:1972434/1‑62 (MQ=255) ttcttAAAACGATGCTACAGCAACAGGGTAGCCGCACCGAAGTCTTAAGTGGGCAACAAGcc  >  1:1928144/1‑62 (MQ=255) ttcttAAAACGATGCTACAGCAACAGGGTAGCCGCACCGAAGTCTTAAGTGGGCAACAAGcc  >  1:1709635/1‑62 (MQ=255) ttcttAAAACGATGCTACAGCAACAGGGTAGCCGCACCGAAGTCTTAAGTGGGCAACAAGcc  >  1:1575966/1‑62 (MQ=255) ttcttAAAACGATGCTACAGCAACAGGGTAGCCGCACCGAAGTCTTAAGTGGGCAACAAGcc  >  1:145301/1‑62 (MQ=255) ttcttAAAACGATGCTACAGCAACAGGGTAGCCGCACCGAAGTCTTAAGTGGGCAACAAGcc  >  1:1396219/1‑62 (MQ=255) ttcttAAAACGATGCTACAGCAACAGGGTAGCCGCACCGAAGTCTTAAGTGGGCAACAAGcc  >  1:131136/1‑62 (MQ=255) |                                                              TTCTTAAAACGATGCTACAGCAACAGGGTAGCCGCACCGAAGTCTTAAGTGGGCAACAAGCC  >  minE/172536‑172597

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑