Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1991951 1991983 33 13 [0] [1] 62 mltC membrane‑bound lytic murein transglycosylase C

TGATAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTTGA  >  minE/1991981‑1992043
   |                                                           
tGATAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGtt  <  1:3124406/62‑2 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:3635189/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:102870/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:3022166/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:3093807/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:3138357/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:3155296/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:3259953/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:3380144/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:3471983/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:3528076/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:3544226/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:3551343/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:3555742/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:3579518/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:362437/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:2954150/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:37141/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:427338/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:454501/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:487127/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:569202/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:573304/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:718069/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:788130/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:803345/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:805214/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:869939/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:888216/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:95362/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:984970/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:1612016/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:1047658/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:1050594/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:1059578/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:1077495/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:1103226/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:1238891/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:1251715/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:1260013/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:1365881/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:1387944/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:1422211/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:1468785/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:1478812/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:1575001/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:2825922/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:1649853/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:173242/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:1828612/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:1904029/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:1952362/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:2068279/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:2154683/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:223280/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:225009/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:2299300/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:2311361/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:2448629/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:2548341/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:2566200/60‑1 (MQ=255)
   tAAACGTGCGAACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTtga  <  1:701556/60‑1 (MQ=255)
   |                                                           
TGATAAACGTGCGCACAAATATCTCGGCATGGTCCGCCAGGCGTCACGGAAATATGGCGTTGA  >  minE/1991981‑1992043

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: