Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1992543	1992553	11	17 [0]	[0] 32	mltC/nupG	membrane‑bound lytic murein transglycosylase C/nucleoside transporter

CATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAA  >  minE/1992554‑1992615 |                                                              caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:2549824/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:796662/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:718059/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:708952/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:580905/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:511822/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:49818/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:442822/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:391818/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:351882/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:3439485/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:3304284/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:3303403/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:2793437/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:2724950/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:2720408/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:1037610/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:2505069/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:2503686/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:2423002/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:2419826/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:2385179/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:2266643/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:2141441/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:1964071/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:1815295/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:1626538/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:1419257/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:135567/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:1334483/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:1149684/62‑1 (MQ=255) caTCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACaaaaaa  <  1:111753/62‑1 (MQ=255) |                                                              CATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAA  >  minE/1992554‑1992615

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑