Missing coverage evidence...
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ATAATACGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTG  >  minE/2004473‑2004534 |                                                              ataataTGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:444599/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:2278436/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:88468/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:853238/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:78461/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:733291/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:467174/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:3560402/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:3173097/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:3163875/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:3137617/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:3085100/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:2907971/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:2695047/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:2443075/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:24388/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:1017296/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:2200103/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:2114066/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:2109034/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:1795814/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:1746062/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:1742731/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:1546356/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:1395799/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:1297594/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:1271118/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:1265143/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:1185047/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:1028038/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTg  <  1:1023885/62‑1 (MQ=255) ataataCGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGACAGTCAGTTTCTg  <  1:2173356/62‑1 (MQ=255) |                                                              ATAATACGGCCCAGCGTGGAGTGCAGCTGTGCCACTTCCAGCGTGTTGCCAGTCAGTTTCTG  >  minE/2004473‑2004534

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑