Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2037822	2037864	43	9 [0]	[0] 66	zupT	predicted dioxygenase

CTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCG  >  minE/2037865‑2037926 |                                                              cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:3242638/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:3392289/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:3354092/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:3346381/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:3320688/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:3309288/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:3284667/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:3278240/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:3262447/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:3410556/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:3203708/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:3026763/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:2959821/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:2912544/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:2878506/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:2877144/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:2837983/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:2829212/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:3414764/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:3422184/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:3456492/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:3519559/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:3526292/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:3567525/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:3608103/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:511747/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:532221/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:545759/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:57808/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:583641/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:684466/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:93631/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:963782/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:1540414/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:2363937/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:2175038/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:1916964/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:190751/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:1862448/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:1787981/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:1675583/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:1662736/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:23785/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:1488900/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:1462597/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:1444725/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:1334662/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:118736/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:1056914/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:1055030/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:1030644/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:2524723/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:2536155/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:2582313/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:2585669/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:2594474/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:2603972/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:2623086/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:2630961/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:2633846/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:2644683/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:2726174/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:2729566/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:2780488/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCg  <  1:2799876/62‑1 (MQ=255) cTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGAAAGAACCCg  <  1:272092/62‑1 (MQ=255) |                                                              CTTAACTAAAGGTGTCATTTTGATATCCTCACAATACGCTTGTTCGGCGGAGTAAGAACCCG  >  minE/2037865‑2037926

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑