Missing coverage evidence...
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CTCAACCATATGTTTGATTCGCTGCTTGAACTGCGCCAGGAAGAGTTAATCGCTCGTGAGCG  >  minE/2063434‑2063495 |                                                              ctcaACCATATGTTTGATTCGCTGCTTGAACTGCGCCAGGAAGAGTTAATCGCTCGTGAgcg  >  1:1174758/1‑62 (MQ=255) ctcaACCATATGTTTGATTCGCTGCTTGAACTGCGCCAGGAAGAGTTAATCGCTCGTGAgcg  >  1:1278743/1‑62 (MQ=255) ctcaACCATATGTTTGATTCGCTGCTTGAACTGCGCCAGGAAGAGTTAATCGCTCGTGAgcg  >  1:1391800/1‑62 (MQ=255) ctcaACCATATGTTTGATTCGCTGCTTGAACTGCGCCAGGAAGAGTTAATCGCTCGTGAgcg  >  1:1396529/1‑62 (MQ=255) ctcaACCATATGTTTGATTCGCTGCTTGAACTGCGCCAGGAAGAGTTAATCGCTCGTGAgcg  >  1:1572641/1‑62 (MQ=255) ctcaACCATATGTTTGATTCGCTGCTTGAACTGCGCCAGGAAGAGTTAATCGCTCGTGAgcg  >  1:223828/1‑62 (MQ=255) ctcaACCATATGTTTGATTCGCTGCTTGAACTGCGCCAGGAAGAGTTAATCGCTCGTGAgcg  >  1:2679790/1‑62 (MQ=255) ctcaACCATATGTTTGATTCGCTGCTTGAACTGCGCCAGGAAGAGTTAATCGCTCGTGAgcg  >  1:2788628/1‑62 (MQ=255) ctcaACCATATGTTTGATTCGCTGCTTGAACTGCGCCAGGAAGAGTTAATCGCTCGTGAgcg  >  1:2870921/1‑62 (MQ=255) ctcaACCATATGTTTGATTCGCTGCTTGAACTGCGCCAGGAAGAGTTAATCGCTCGTGAgcg  >  1:3353696/1‑62 (MQ=255) ctcaACCATATGTTTGATTCGCTGCTTGAACTGCGCCAGGAAGAGTTAATCGCTCGTGAgcg  >  1:3414543/1‑62 (MQ=255) ctcaACCATATGTTTGATTCGCTGCTTGAACTGCGCCAGGAAGAGTTAATCGCTCGTGAgcg  >  1:3420665/1‑62 (MQ=255) ctcaACCATATGTTTGATTCGCTGCTTGAACTGCGCCAGGAAGAGTTAATCGCTCGTGAgcg  >  1:3460031/1‑62 (MQ=255) ctcaACCATATGTTTGATTCGCTGCTTGAACTGCGCCAGGAAGAGTTAATCGCTCGTGAgcg  >  1:403928/1‑62 (MQ=255) ctcaACCATATGTTTGATTCGCTGCTTGAACTGCGCCAGGAAGAGTTAATCGCTCGTGAgcg  >  1:573543/1‑62 (MQ=255) ctcaACCATATGTTTGATTCGCTGCTTGAACTGCGCCAGGAAGAGTTAATCGCTCGTGAgcg  >  1:914703/1‑62 (MQ=255) |                                                              CTCAACCATATGTTTGATTCGCTGCTTGAACTGCGCCAGGAAGAGTTAATCGCTCGTGAGCG  >  minE/2063434‑2063495

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑