Missing coverage evidence...
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CGAGATGGCCTAATGCCGCGGCCAGATCGCTGGGGCCGACGAAGATGCCGTCTACGCCTTC  >  minE/2098083‑2098143 |                                                             cGAGATGGCCTAATGCCGCGGCCAGATCGCTGGGGCCGACGAAGTTGCCGTCTACGCCTTc  <  1:195584/61‑1 (MQ=255) cGAGATGGCCTAATGCCGCGGCCAGATCGCTGGGGCCGACGAAGATGCCGTCTACGCCTTc  <  1:2732409/61‑1 (MQ=255) cGAGATGGCCTAATGCCGCGGCCAGATCGCTGGGGCCGACGAAGATGCCGTCTACGCCTTc  <  1:909738/61‑1 (MQ=255) cGAGATGGCCTAATGCCGCGGCCAGATCGCTGGGGCCGACGAAGATGCCGTCTACGCCTTc  <  1:788358/61‑1 (MQ=255) cGAGATGGCCTAATGCCGCGGCCAGATCGCTGGGGCCGACGAAGATGCCGTCTACGCCTTc  <  1:777461/61‑1 (MQ=255) cGAGATGGCCTAATGCCGCGGCCAGATCGCTGGGGCCGACGAAGATGCCGTCTACGCCTTc  <  1:614119/61‑1 (MQ=255) cGAGATGGCCTAATGCCGCGGCCAGATCGCTGGGGCCGACGAAGATGCCGTCTACGCCTTc  <  1:532899/61‑1 (MQ=255) cGAGATGGCCTAATGCCGCGGCCAGATCGCTGGGGCCGACGAAGATGCCGTCTACGCCTTc  <  1:465726/61‑1 (MQ=255) cGAGATGGCCTAATGCCGCGGCCAGATCGCTGGGGCCGACGAAGATGCCGTCTACGCCTTc  <  1:392486/61‑1 (MQ=255) cGAGATGGCCTAATGCCGCGGCCAGATCGCTGGGGCCGACGAAGATGCCGTCTACGCCTTc  <  1:378970/61‑1 (MQ=255) cGAGATGGCCTAATGCCGCGGCCAGATCGCTGGGGCCGACGAAGATGCCGTCTACGCCTTc  <  1:3389960/61‑1 (MQ=255) cGAGATGGCCTAATGCCGCGGCCAGATCGCTGGGGCCGACGAAGATGCCGTCTACGCCTTc  <  1:3385764/61‑1 (MQ=255) cGAGATGGCCTAATGCCGCGGCCAGATCGCTGGGGCCGACGAAGATGCCGTCTACGCCTTc  <  1:324422/61‑1 (MQ=255) cGAGATGGCCTAATGCCGCGGCCAGATCGCTGGGGCCGACGAAGATGCCGTCTACGCCTTc  <  1:1016632/61‑1 (MQ=255) cGAGATGGCCTAATGCCGCGGCCAGATCGCTGGGGCCGACGAAGATGCCGTCTACGCCTTc  <  1:2652787/61‑1 (MQ=255) cGAGATGGCCTAATGCCGCGGCCAGATCGCTGGGGCCGACGAAGATGCCGTCTACGCCTTc  <  1:2293167/61‑1 (MQ=255) cGAGATGGCCTAATGCCGCGGCCAGATCGCTGGGGCCGACGAAGATGCCGTCTACGCCTTc  <  1:224542/61‑1 (MQ=255) cGAGATGGCCTAATGCCGCGGCCAGATCGCTGGGGCCGACGAAGATGCCGTCTACGCCTTc  <  1:2230140/61‑1 (MQ=255) cGAGATGGCCTAATGCCGCGGCCAGATCGCTGGGGCCGACGAAGATGCCGTCTACGCCTTc  <  1:2157595/61‑1 (MQ=255) cGAGATGGCCTAATGCCGCGGCCAGATCGCTGGGGCCGACGAAGATGCCGTCTACGCCTTc  <  1:1981216/61‑1 (MQ=255) cGAGATGGCCTAATGCCGCGGCCAGATCGCTGGGGCCGACGAAGATGCCGTCTACGCCTTc  <  1:1937559/61‑1 (MQ=255) cGAGATGGCCTAATGCCGCGGCCAGATCGCTGGGGCCGACGAAGATGCCGTCTACGCCTTc  <  1:1700051/61‑1 (MQ=255) cGAGATGGCCTAATGCCGCGGCCAGATCGCTGGGGCCGACGAAGATGCCGTCTACGCCTTc  <  1:162046/61‑1 (MQ=255) cGAGATGGCCTAATGCCGCGGCCAGAGCGCTGGGGCCGACGAAGATGCCGTCTACGCCTTc  <  1:172192/61‑1 (MQ=255) |                                                             CGAGATGGCCTAATGCCGCGGCCAGATCGCTGGGGCCGACGAAGATGCCGTCTACGCCTTC  >  minE/2098083‑2098143

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑