Missing coverage evidence...
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ACGGGATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAGC  >  minE/2106222‑2106284   |                                                             aCGGGATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTG‑‑GCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:197687/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCTGGATTAACGGACAAgc  <  1:3577307/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAAGGGACAAgc  <  1:904964/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:3528939/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:3056395/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:3099563/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:3164347/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:3191151/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:3414633/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:343111/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:3479678/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:3502876/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:3507637/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:3515927/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:289099/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:443099/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:469541/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:587581/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:670296/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:80629/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:976936/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:2110131/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:1130668/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:1538188/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:1541323/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:1718619/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:1764897/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:1888026/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:1925625/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:1993929/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:2060731/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:1119148/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:2240061/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:2270499/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:2448516/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:2647059/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:2738815/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:2814587/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAgc  <  1:2841898/61‑1 (MQ=255)   gggATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACCGACAAgc  <  1:2116791/61‑1 (MQ=255)   |                                                             ACGGGATGACAGGTTTACATCACCGCGAACCGGGAATGGTTGGCGCGGGATTAACGGACAAGC  >  minE/2106222‑2106284

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑