Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2111249	2111256	8	6 [0]	[0] 32	agaD	N‑acetylgalactosamine‑specific enzyme IID component of PTS

GATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACTTT  >  minE/2111257‑2111316 |                                                            gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:259769/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:775614/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:750912/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:531368/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:527081/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:473260/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:464418/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:366445/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:3570681/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:3557880/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:3241484/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:3137388/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:29687/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:2879948/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:2840193/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:2606613/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:1094663/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:2584151/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:2290735/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:2189241/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:2140956/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:2062881/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:2008830/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:1776982/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:1716718/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:159038/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:1556717/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:1519660/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:1462218/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:1313114/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:1188794/60‑1 (MQ=255) gATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACttt  <  1:1156128/60‑1 (MQ=255) |                                                            GATGTATTACTTCCTGCGGGTGAAAAAAGCGCATCCGGTGCTGTTAATCGGCGTGACTTT  >  minE/2111257‑2111316

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑