Missing coverage evidence...
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ATCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATC  >  minE/2121392‑2121453 |                                                              aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:3301630/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:2687281/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:2731035/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:2931985/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:297603/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:2994679/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:2997931/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:3032196/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:3037118/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:3040270/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:3230148/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:262671/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:3352189/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:3380253/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:3512554/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:3560091/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:3636973/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:369900/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:390855/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:549890/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:734884/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:937397/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:2178734/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:132093/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:1392051/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:1425494/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:1482055/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:148505/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:152715/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:162770/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:1643130/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:2047263/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:2096759/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:1102740/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:2201533/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:221336/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:223089/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:23107/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:2395287/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:2417228/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:2467705/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:258326/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:2625299/62‑1 (MQ=255) aTCGTAGTGCTCACATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATc  <  1:2287086/62‑1 (MQ=255) |                                                              ATCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATC  >  minE/2121392‑2121453

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑