Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2140214	2140273	60	8 [0]	[0] 79	infB	fused protein chain initiation factor 2, IF2

TGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGACG  >  minE/2140274‑2140327 |                                                      tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:2932813/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:3292129/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:3278149/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:3260185/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:3164655/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:3097260/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:3070769/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:3060243/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:2997788/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:2972320/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:3305025/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:290174/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:2886328/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:2837767/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:2818292/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:2817991/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:2801162/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:2775948/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:2761778/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:2648595/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:3559001/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:927559/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:913782/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:859922/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:804829/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:720811/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:72042/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:497055/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:362733/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:3614494/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:2609292/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:3548447/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:3543149/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:3528145/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:3484906/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:3479488/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:3475446/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:340811/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:3358880/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:3339983/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:1373620/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:1053124/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:168685/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:1614957/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:1593829/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:1591217/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:1488536/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:1483612/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:1426657/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:17320/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:1305051/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:1200244/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:1182170/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:1159193/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:1138821/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:1103883/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:1069543/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:1054659/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:190792/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:2383067/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:2381780/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:2320572/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:2313053/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:2280189/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:2087338/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:2016203/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:2003973/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:1979910/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:1969582/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:1962365/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:1949794/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:1942832/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:1922897/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:173436/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAc   >  1:1368189/1‑53 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTCGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:1501233/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGAGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:2021130/1‑54 (MQ=255) tGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGAATCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGAcg  >  1:2519741/1‑54 (MQ=255) tGCTTCGTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGtgtttgt                  >  1:11033/1‑38 (MQ=255) |                                                      TGCTTCTTCACGATCAGCTTTTGATTCAGCGTGTTTGTTGCCTTTCTTCGGACG  >  minE/2140274‑2140327

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑