Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2140938	2140956	19	5 [0]	[0] 66	infB	fused protein chain initiation factor 2, IF2

GATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACTT  >  minE/2140957‑2141017 |                                                             gATTCGGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:493095/1‑60 (MQ=255) gATTCGGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:488768/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTTGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:2298758/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGaca                     >  1:2913779/1‑42 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTcagca       >  1:1663531/1‑56 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTcag         >  1:1394694/1‑54 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTcag         >  1:2161629/1‑54 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTca          >  1:2744565/1‑53 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTca          >  1:553176/1‑53 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGAc    >  1:1674621/1‑59 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACtt  >  1:2777809/1‑61 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACtt  >  1:3354145/1‑61 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:3202937/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:3399537/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:3162661/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:3124209/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:3005112/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:2966288/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:2962376/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:2809017/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:2785835/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:3257139/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:3310327/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:3379933/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:2624720/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:3403010/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:3466067/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:3466517/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:3616881/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:405469/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:708984/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:733429/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:826920/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:965034/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:980391/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:1944578/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:1345384/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:1345791/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:1356412/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:1388887/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:1447480/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:1451787/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:150220/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:1521666/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:1552685/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:1553988/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:1574089/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:1620406/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:1635291/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:1683151/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:1740205/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:2676468/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:1952338/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:2018996/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:2056301/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:2173749/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:2462880/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:2463760/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:2487755/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:2545828/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:2557740/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:2571913/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:1046869/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTATCATGTGCAGACACag                  >  1:312784/1‑45 (MQ=255) gATTCAGGTGGTAAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:2365208/1‑60 (MQ=255) gATTCAGGTCGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACt   >  1:3320495/1‑60 (MQ=255) |                                                             GATTCAGGTGGTCAATCAAAGTCTGTTTCTCTTGTGCAGACACAGAGTCGTCAGCAGACTT  >  minE/2140957‑2141017

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑